Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FAM208BQ5VWN6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FAM208BQ5VWN6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FAM208BQ5VWN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FAM208BQ5VWN6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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