Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFCAB2Q5VUJ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFCAB2Q5VUJ9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms