Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACHD1Q5VU97 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACHD1Q5VU97 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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