Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC183Q5T5S1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC183Q5T5S1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms