Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms