Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms