Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC93Q567U6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms