Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC57Q2TAC2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC57Q2TAC2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms