Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC96Q2M329 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms