Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms