Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UPP1Q16831 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms