Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRIK5Q16478 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRIK5Q16478 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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