Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TNXAQ16473 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNXAQ16473 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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