Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZIC1Q15915 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms