Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA2Q15822 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA2Q15822 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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