Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITSN1Q15811 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITSN1Q15811 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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