Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SIX1Q15475 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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SIX1Q15475 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SIX1Q15475 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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