Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
POLD3Q15054 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
POLD3Q15054 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms