Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GPNMBQ14956 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPNMBQ14956 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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