Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1CQ13936 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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