Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKP1Q13835 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKP1Q13835 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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