Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TCIRG1Q13488 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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