Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDAP1Q13442 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDAP1Q13442 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms