Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SCGB2A2Q13296 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SCGB2A2Q13296 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SCGB2A2Q13296 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SCGB2A2Q13296 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SCGB2A2Q13296 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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SCGB2A2Q13296 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SCGB2A2Q13296 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB2A2Q13296 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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