Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLN3Q13286 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms