Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GRIN2AQ12879 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2AQ12879 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms