Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTN1Q12860 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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