Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TROQ12816 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TROQ12816 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TROQ12816 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TROQ12816 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TROQ12816 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TROQ12816 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TROQ12816 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TROQ12816 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TROQ12816 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TROQ12816 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TROQ12816 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TROQ12816 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
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