Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYP4F3Q08477 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYP4F3Q08477 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms