Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SOX4Q06945 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms