Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms