Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TOP2BQ02880 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TOP2BQ02880 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms