Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DEFA6Q01524 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DEFA6Q01524 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms