Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms