Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSNK2A1P68400 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSNK2A1P68400 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms