Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P62684 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms