Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RPS29P62273 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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