Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ARF3P61204 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARF3P61204 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARF3P61204 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARF3P61204 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARF3P61204 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARF3P61204 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARF3P61204 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARF3P61204 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARF3P61204 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms