Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB25P57735 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms