Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CTBP2P56545 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms