Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRCA2P51587 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRCA2P51587 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms