Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP153P49790 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP153P49790 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP153P49790 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP153P49790 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUP153P49790 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUP153P49790 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUP153P49790 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUP153P49790 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUP153P49790 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUP153P49790 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUP153P49790 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUP153P49790 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms