Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APOBEC1P41238 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms