Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATP5C1P36542 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms