Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
APOBEC3AP31941 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOBEC3AP31941 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms