Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXC13P31276 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXC13P31276 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms