Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TM4SF1P30408 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF1P30408 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms