Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGA3P26006 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms