Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EFNA1P20827 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms