Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB1P14653 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HOXB1P14653 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB1P14653 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms